La Biblioteca Digital es una sección dentro del portal IMTA que lleva más de cinco años en circulación pública. Tiene alrededor de 130 libros en su acervo, y entre los más consultados son:
- Atlas de Vulnerabilidad Hídrica en México. (casi 13,000 descargas).
- Leyendas del Agua en México. ( casi 5,500 descargas).
La mayoría de las publicaciones del portal son publicaciones realizadas por especialistas del Instituto con el fin de transmitir conocimientos y hacer con que llegue a todo el público.