1. Presentación del proyecto
El pasado viernes el Govern de Generalitat presentó el proyecto de investigación “Red de vigilancia del SARS-CoV-2 en aguas residuales”, iniciado el pasado mes de julio por los departamentos de Territorio y Sostenibilidad, a través del ACA, y del departamento de Salud, juntamente con el ICRA (Insitut Català de Recerca de l’Aigua), la Universidad de Barcelona y el centro tecnológico de Catalunya Eurecat.
Link a la nota de prensa del Govern.
2. Proyecto coordinado con entidades investigadoras
El proyecto, que ha supuesto una inversión de 400.000 euros financiados por la ACA, analiza la evolución de la circulación del coronavirus en el 80% del total de las aguas residuales generadas en Cataluña, tomando muestras en 56 depuradoras y obteniendo resultados en 48 horas.
La red de seguimiento para analizar la evolución de la Covid-19 en Cataluña está coordinada por la Agencia Catalana del Agua (ACA), que ha financiado el proyecto con 400.00 euros. En el proyecto también participan los principales centros de investigación catalanes como el Instituto Catalán de Investigación del Agua (ICRA), el Eurecat y la Universidad de Barcelona.
El proyecto cuenta con la participación de tres laboratorios, dos de ellos de la Universidad de Barcelona (UB) especializados en el análisis de virus en muestras ambientales y clínicas (el laboratorio de Biología Molecular de Virus Entéricos y el laboratorio de Virus, Bacterias y Protozoos de interés en Salud Pública y Seguridad Alimentaria), y el Center for Omics Sciences (COS) de Eurecat en Reus.
3. Resultados
Los resultados semanales obtenidos con este proyecto de investigación permitiendo permiten al Departamento de Salud y el PROCICAT (Pla territorial de Protección Civil de Catalunya) disponer de información anticipada para activar los mecanismos y evaluar las acciones propuestas para la protección de la salud.
Se realizan controles analíticos a las aguas residuales a la entrada de un total de 56 depuradoras que depuran el 80% de las aguas residuales de Catalunya. Estas EDAR han sido seleccionadas atendiendo a criterios de población servida (80% de la población de Cataluña está servida por estas 56 EDAR) y equilibrio territorial (como mínimo una EDAR por comarca, a excepción del Moianès por criterios técnicos). Las EDAR recogen muestras integradas que se envían a 3 laboratorios especializados donde se realizan las analíticas del material genético del SARS-Cov-2; los resultados se publican en este visor web después de verificar la calidad e integridad de todo el proceso.
Se debe tener en cuenta que episodios de intensas lluvias pueden contribuir a diluir la concentración de carga genómica en el agua residual.
El Departamento de Salud y el Procicat disponen así de una variable más a la hora de tomar decisiones para reducir la propagación del coronavirus. Este proyecto confirma la presencia generalizada y creciente de restos genéticos del virus en las aguas residuales analizadas de los últimos días.
La evolución temporal muestra un aumento del número de EDAR en que los genes no solo son detectables, sino que se incrementan hasta concentraciones elevadas (Verde -> Amarillo -> Naranja -> Rojo). Esto indica un aumento en la circulación del virus entre la población asistida por estas estaciones depuradoras, y que, desgraciadamente, coincide con la evolución de la pandemia en Catalunya.
Hay que destacar que al inicio del proyecto en la red de EDAR solo se detectaban concentraciones elevadas en aquellas EDAR que asistían las poblaciones de Lleida y de Fondarella, coincidiendo con el rebrote de principios de julio en la comarca del Segrià.
Desde mediados de agosto se pudo ver claramente el incremento de las concentraciones en la mayoría de EDAR de la provincia de Barcelona (sobre todo en el área metropolitana) y en algunas de las EDAR de la provincia de Girona, especialmente en localidades costeras con gran influencia del turismo estival. Los últimos análisis (octubre) muestran concentraciones elevadas en la mayoría de EDAR monitorizadas, lo que indica una circulación alta y sostenida del virus entre la población asistida.
La siguiente figura muestra la evolución temporal de las concentraciones de los restos génicos del virus SARS-CoV-2 en las 56 EDAR monitorizadas desde del inicio del programa de vigilancia. El código de colores indica la concentración de los genes virales por litro de agua residual y va desde el color verde, para concentraciones por debajo del límite de detección (<= 10^2 copias génicas por litro de agua residual copias/L), al color rojo, que indica concentraciones muy elevadas (>= 10^5 copias/L).
La monitorización consiste en la toma de muestras en el agua de entrada de las depuradoras (antes de su tratamiento). Posteriormente, las muestras se transportan, con todas las medidas de seguridad, a 3 laboratorios vinculados a los centros de investigación y tecnológicos de referencia. La cuantificación de los restos genéticos del SARS-CoV-2 se hace mediante la amplificación del ARN presente en las muestras con un método donde se analiza la concentración del ARN viral mediante PCR cuantitativa. Los resultados se tienen en 48 horas.
Los resultados de los últimos meses, y que ahora se abren a la ciudadanía después de calibrar la metodología, se han puesto al servicio del Departamento de Salud para la toma de decisiones y medidas durante los últimos meses de la pandemia, buscando la detección precoz de la circulación del virus en áreas determinadas y como un indicador adicional de la evolución y tendencias de la circulación del virus en las diferentes comarcas de Catalunya.
4. El Visor Sarsaigua
Este proyecto de investigación ha creado el Visor Web Sarsaigua para la consulta del estado actual de la circulación del virus SARS-CoV-2 en diferentes municipios de Catalunya a través del agua residual de entradas a diversas depuradoras. Esta plataforma se abrió al público el pasado viernes, y se pueden consultar los resultados semanales de la presencia y las oscilaciones de restos genéticos del virus en las aguas residuales.
En el link se accede al Visor Sarsaigua. En la siguiente figura se presenta un aspecto del visor Web y la leyenda del mapa.
En el visor web se pueden observar el Mapa donde se localizan las EDAR analizadas, los municipios asistidos por cada EDAR y el nivel de circulación del virus en base a la concentración absoluta de la diana génica más abundante (en unidades logarítmicas) y una escala de color. En cada EDAR se muestra también la tendencia de cambio (símbolos que representan una tendencia al alza, estable, o a la baja) de las concentraciones de la semana en curso respecto la semana anterior.
Al pulsar el municipio servido por una EDAR se puede consultar la evolución temporal de las dianas genéticas analizadas. Los resultados integran información de los diferentes municipios asistidos por una misma EDAR. Todos los municipios servidos por una misma EDAR presentan los mismos resultados.
En el visor existe la posibilidad de visualizar los datos por semanas, así se puede observar como en la semana del 6 al 12 de julio, a diferencia de otras zonas, la depuradora de Lleida mostraba niveles altos de carga genómica y una tendencia ascendente.
Los datos generados por la Red de Vigilancia están disponibles en un repositorio público. Citar como:
Lluís Corominas, Neus Collado, Laura Guerrero-Latorre, Nerea Abasolo-Zabalo, Eduard Anfruns-Estrada, Gabriel Anzaldi-Varaas, … Carles Borrego. (2020). Catalan Surveillance Network of SARS-CoV-2 in Sewage [Data set]. Zenodo.
5. Principales iniciativas a nivel europeo
Diferentes países europeos (Holanda, Suiza, Reino Unido, España, entre otros) han empezado a monitorizar las trazas genéticas del SARS-CoV-2 en aguas residuales, como herramienta para anticipar posibles nuevos rebrotes y para evaluar la efectividad de las medidas implementadas.
La Generalitat de Catalunya, con una firme voluntad de intercambio de datos e información, participó la semana pasada en la reunión a nivel europeo "Surveillance of Covid19 virus in wasterwater" sobre vigilancia del coronavirus en aguas residuales.
El proyecto de investigación catalán es homologable y posiciona Cataluña entre las iniciativas más avanzadas de los países europeos en este ámbito, tal y como se desprende de la información aportada a las reuniones de la “Surveillance of COVID-19 virus in wastewater: Where we stand” donde se ha constatado que es posible realizar detención avanzada del SARS-CoV-2 a partir del análisis de las aguas residuales y, a la vez, la necesidad de realizar investigación para estandarizar los métodos con el objetivo que los datos sean fiables.
A continuación se presentan los links para acceder a información adicional.
6. La triple t de los datos del SARS-CoV-2
Desde que se inició la pandemia se han generado una gran cantidad de datos que alrededor de esta crisis sanitaria. Los datos que están ofreciendo las administraciones sobre esta crisis se pueden resumir como la triple t:
- Transparencia de los datos. En una cultura de datos abiertos, y para concienciar a la sociedad de la importancia de aplanar la curva del coronavirus, es importante mantener informada a la población con datos que se sean comparables entre sí.
- Tiempo real de los datos. Para tomar las correctas decisiones, cada vez es más importante disponer de los datos de una manera inmediata.
- Territorializados. Tener datos georeferenciados permite visualizar/analizar los datos por diferentes ámbitos geográficos. (Regiones Sanitarias, Comarcas/Municipios, etc.)
7. El impacto en twitter de la #Sarsaigua_cat
Desde el pasado viernes ha habido una importante actividad en redes sociales por parte de las diferentes entidades e investigadores relacionados con el proyecto, utilizando el hashtag #Sarsaigua_cat. Ha habido 87 cuentas que han contribuido en compartir en redes la presentación de este proyecto de investigación.
Lo que se investiga en red, se comunica en red.
