En los últimos años la cianobacteria está atacando el Lago Atitlán fruto de los vertidos agrícolas y de las aguas residuales de las ciudades y cultivos que rodean al Lago. La Cooperación Española junto con la Mancomunidad del Lago Atitlán trabajan juntas para apoyar la construcción de plantas de tratamiento de aguas residuales en el Lago.
Aquí la historia de la primera de ellas, en San Marcos de La Laguna.